A Fine-Tuned Universe

KEGG pathway mapper 본문

Bioinformatics

KEGG pathway mapper

정재준 2021. 8. 13. 09:28
728x90

KEGG pathway mapper는

내가 분석하고자 하는 유전체 또는 유전자 세트가 KEGG pathway 상에서 어디에 해당하는지 색깔로 표시해주는 도구이다

https://www.genome.jp/kegg/mapper/

 

1. amino acid fasta 준비

GenBank FTP에 들어가서 faa 파일을 다운로드 받는다

 

2. BlastKOALA에 faa를 업로드하고 이메일로 전송되는 결과를 다운로드 받는다

 

3. KEGG pathwaty mapper - reconstruct 에서 BlastKOALA의 결과파일을 붙여넣고 exec을 클릭한다

 

 

 

LIST