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KEGG mapper

정재준 2020. 11. 19. 00:26
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www.genome.jp/kegg/mapper.html

 

KEGG Mapper

About KEGG Mapper KEGG Mapper is a collection of tools for KEGG mapping: most popular KEGG pathway mapping, as well as BRITE mapping and MODULE mapping. In this new release, fourteen existing tools were reorganized into just five tools. Three of them, "Rec

www.genome.jp

 

사용자가 업로드 하는 유전정보를 대사 경로 상에 색칠? 해주는 도구

 

여러가지 메뉴가 있지만 지금 사용하는 것은 Search & Color pathway 도구

 

위의 KEGG mapper 메인으로 들어가서 왼쪽 메뉴 중 Search & Color pathway를 선택한다

 

input file을 올리거나 내용을 빈 칸에 입력후 exec (execute)를 클릭하면 된다

 

문제는 input file을 준비하는 일인데

 

K13774 #FF0000
K11731 #FF0000
K00981 #FF0000
K13778 #FF0000
K13777 #FF0000

 

이렇게 생겼다 tsv 파일이다

 

앞에는 KO number 뒤에는 color code이다 #FF0000은 빨간색이다

 

오늘은 여기까지 적고 나중에 업데이트 하는 걸로...

 

 

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