A Fine-Tuned Universe

Bioinformatics를 잘 하시는 분들은 스크립트로 여러가지 일을 뚝딱뚝딱 하시겠지만 많은 생물학 기반의 연구자와 대학원생들은 갑자기 유전체나 시퀀스 분석을 해야하는 상황을 만나면 당황할 수 밖에 없다. 많은 bioinformatics tool이 리눅스에서 돌아가는데 리눅스도 모르고 설치하는 것도 잘 모르겠고 각종 프로그래밍 언어도 모르고... 아무것도 모르는 상태에서 배워가면서 사용하면서 부딪히는 문제들을 두서없이 메모해서 업데이트하고 있다. 나 같은 사람이 또 있다면 도움이 되길... Official Roary sites https://sanger-pathogens.github.io/Roary/ https://github.com/microgenomics/tutorials/blob/master/p..

https://fine-tuned.tistory.com/132 [cmd] 커맨드라인에서 알집으로 압축풀기 많은 파일을 반복적으로 다루어야 하는데 마우스 클릭을 계속하려니 느리고 짜증난다 리눅스에서 하려니 리눅스가 설치되어 있지도 않고 익숙하지도 않다 커맨드라인에서 zip, unzip, tar 사용하 fine-tuned.tistory.com 조금 전 포스팅에서 커맨드라인에서 알집으로 압축풀기를 다루었는데 잘 안되는 것이 있었다 alzipcon -x 파일명 을 실행하면 압축파일 안에는 별도의 폴더가 없는데도 기본적으로 확장자까지 포함된 파일명과 동일한 폴더를 만들고 그 안에 압축을 푸는 것이었다. -xf 옵션이 도움이 될까 싶어 alzipcon -xf 파일명 이렇게 실행시키면 ERROR : 잘못된 인자 : ..

많은 파일을 반복적으로 다루어야 하는데 마우스 클릭을 계속하려니 느리고 짜증난다 리눅스에서 하려니 리눅스가 설치되어 있지도 않고 익숙하지도 않다 커맨드라인에서 zip, unzip, tar 사용하려니 영어도 읽기 싫고 뭐가 자꾸 잘 안된다 이런 분들께 추천드린다 커맨드라인에서 알집으로 압축풀기 1. 환경 변수의 PATH에 알집이 설치되어 있는 경로를 추가하기 알집이 설치되어 있어도 원하는 폴더에서 사용하려면 Path에 알집의경로가 포함되어 있어야 한다. 그래야 내가 어느 폴더에 있든지 알집명령어를 사용할 수 있다. 제어판에서 환경변수 편집을 클릭한다. 우측 상단 검색 창에서 환경변수를 검색하면 바로 나온다. Path를 선택 후 편집을 클릭한다. Path를 더블클릭해도 동일하다 새로만들기를 클릭한다 알집이 ..