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목록openrefine (1)
A Fine-Tuned Universe
Openrefine을 이용한 텍스트 편집
RNA-seq Fastq 파일을 sickle과 bwa, samtools, bedtools를 이용해 RPKM 값을 구했다 결과를 열어보니 annotation 에 ID=cds-QHU86080.1;Parent=gene-D3800_08820;Dbxref=NCBI_GP:QHU86080.1;Name=QHU86080.1;gbkey=CDS;inference=COORDINATES: similar to AA sequence:RefSeq:WP_002739195.1;locus_tag=D3800_08820;product=DUF928 domain-containing protein;protein_id=QHU86080.1;transl_table=11 이렇게 길게 적혀있다. 실제로 필요한 부분은 밑줄 친 locus tag과 produ..
Bioinformatics
2020. 11. 16. 16:28