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내가 사용한 Nucmer 명령어 모음 본문
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nucmer --prefix=lab_high_nucmer lab.fasta high.fasta
# Lab strain 과 high-resistance strain의 genome을 alignment
show-snps -C -T lab_high_nucmer.delta > lab_high.snps
SNP을 찾되 좀 더 확실한 mutation만 (이 부분은 잘 이해못했음) Tab-delimited 파일로 정리
다른 유전체 분석할 때는 fasta 파일 이름과 prefix 바꾸면 된다
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