A Fine-Tuned Universe

PGAP, input files 본문

Bioinformatics

PGAP, input files

정재준 2019. 7. 26. 23:20
728x90

웹버전의 PGAP로 세균 유전체 분석을 해보려고 한다.

http://pgaweb.vlcc.cn


<Input file 얻기>

NCBI Assembly 에 접속

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly

원하는 미생물 검색 후 assembly accession number 클릭


오른쪽에 Download GenBank Assembly 클릭


다운로드 받아야 할 파일들

(Accession number) cds_from_genomic.fna.gz

(Accession number) protein.faa.gz

(Accession number) feature_table.txt.gz



LIST

'Bioinformatics' 카테고리의 다른 글

MUMmer 결과의 header 정리  (0) 2019.08.05
우분투에서 소프트웨어 설치  (0) 2019.07.30
내가 사용한 Nucmer 명령어 모음  (0) 2019.07.20
Nucmer 결과 파일의 Header 정리  (0) 2019.07.19
우분투에서 Mummer 설치  (0) 2019.07.01