A Fine-Tuned Universe

postnuc returned non-zero, nucmer error message 본문

Bioinformatics

postnuc returned non-zero, nucmer error message

정재준 2019. 8. 7. 09:36
728x90

4: FINISHING DATA

ERROR: Could not parse input from 'Query File'. 

Please check the filename and format, or file a bug report

ERROR: postnuc returned non-zero


이 에러메시지가 왜 뜨는지 검색해보면 여러가지 의견이 많은데

내 경험상 query file을 우분투에서 저장하면 해결된다.


다시 말해서 윈도에서 GenBank 등에서 다운로드 받은 파일을 그대로 우분투로 옮겨서 사용하면 이런 에러메시지가 뜨고

우분투에서 텍스트편집기를 열고 거기에 시퀀스를 붙여넣은 다음에 저장하고

그 파일을 사용하면 위와 같은 에러메시지 없이 nucmer가 잘 실행된다


LIST

'Bioinformatics' 카테고리의 다른 글

GNUPlot  (0) 2019.08.07
show-coords 로 delta 파일 활용  (0) 2019.08.07
리눅스 명령어 모음  (0) 2019.08.06
MUMmer 결과의 header 정리  (0) 2019.08.05
우분투에서 소프트웨어 설치  (0) 2019.07.30