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Pan-genome 분석 나름대로 순서 정리 본문
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(2020-04-22 edited)
Prepare nucleotide FASTA file
Go to genome database such NCBI Genome
Search the strain that you want to obtain genome
Go to FTP directory and download nucleotide FASTA file (...genomic.fna.gz)
1. Genome annotation
genome annotation이 안되어있는 경우 nucleotide fasta file을 prokka로 annotation
2.
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