Notice
Recent Posts
Recent Comments
Link
| 일 | 월 | 화 | 수 | 목 | 금 | 토 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | ||
| 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 |
| 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 |
| 20 | 21 | 22 | 23 | 24 | 25 | 26 |
| 27 | 28 | 29 | 30 |
Tags
- 비교유전체
- 증권사레포트
- 주식매매
- 기술적분석
- 지지저항
- 매매일지
- 매매기법
- 주식투자
- 차트분석
- bioinformatics
- 쌍바닥패턴
- 초단타
- 기본적분석
- 지지저항선
- 유전체
- 관심종목
- 스캘핑
- mummer
- 세균
- 이동평균선
- 리눅스
- 우분투
- 분봉차트
- 목표주가
- 추천종목
- W패턴
- 상한가
- 생명정보학
- 생물정보학
- 돌파매매
Archives
- Today
- Total
A Fine-Tuned Universe
Pan-genome 분석 나름대로 순서 정리 본문
728x90
(2020-04-22 edited)
Prepare nucleotide FASTA file
Go to genome database such NCBI Genome
Search the strain that you want to obtain genome
Go to FTP directory and download nucleotide FASTA file (...genomic.fna.gz)
1. Genome annotation
genome annotation이 안되어있는 경우 nucleotide fasta file을 prokka로 annotation
2.
LIST
'Bioinformatics' 카테고리의 다른 글
| RNA-seq data processing using Galaxy and Linux (0) | 2020.11.11 |
|---|---|
| Artemis (Genome analysis, visualization, a circular map) (0) | 2020.08.05 |
| standalone BLAST (계속 수정 중) (0) | 2019.09.19 |
| GNUPlot (0) | 2019.08.07 |
| show-coords 로 delta 파일 활용 (0) | 2019.08.07 |
'Bioinformatics' Related Articles
more
