A Fine-Tuned Universe

최근 SK하이닉스 캔들차트이다 저점인 1번과 2번 지점을 연결하면 하향추세대의 하방추세선을 그릴 수 있다. 4번, 5번, 6번 지점을 연결하면 하향추세대의 상방추세선을 그릴 수 있다. 3번 지점 부근에 가격이 도달했을 때 아래꼬리가 긴 상방도지 캔들이 발생했다. 지지선에서 발생한 상방도지 캔들을 상승반전신호로 해석하고 매수했다면 7번 위치부근에서 매수할 기회를 얻었을 것이다. 7번 위치는 120일 이평선 부근이자 상방추세선 부근이라 좀 더 강한 저항선으로 작용할 가능성이 크다 74000원 부근에서 매수하고 87000원 부근에서 매도 했다면 짧은 시간에 15% 가량의 수익을 낼 수 있었을 것이다

34개의 유전체를 roary로 분석하였다. amino acid identity 50% 기준이다 roary --f ./ -e -n -i 50 -p 64 *.gff 분석한 모든 유전체의 core gene을 query_pan_genome 스크립트로 구하였다 그 전에 분석에 사용한 모든 roary gff 파일과 query_pan_genome -a intersection *.gff 결과 파일은 확장자도 없이 'pan_genome_results' 라는 파일로 나왔다. 엑셀에서 열어보면 아래와 같다 자세히 살펴보면 gene name (gene name이 있는 경우에만, 없을 땐 protein id)가 맨 앞에 있고 그 다음에 콜론(:)이 공백(space)로 구분되어 있고 그 뒤로는 탭으로 구분된 protein id가..

clear 화면을 지우는 명령어입니다 위 화면에서 clear 명명을 치면 싹 지워집니다

Bioinformatics를 잘 하시는 분들은 스크립트로 여러가지 일을 뚝딱뚝딱 하시겠지만 많은 생물학 기반의 연구자와 대학원생들은 갑자기 유전체나 시퀀스 분석을 해야하는 상황을 만나면 당황할 수 밖에 없다. 많은 bioinformatics tool이 리눅스에서 돌아가는데 리눅스도 모르고 설치하는 것도 잘 모르겠고 각종 프로그래밍 언어도 모르고... 아무것도 모르는 상태에서 배워가면서 사용하면서 부딪히는 문제들을 두서없이 메모해서 업데이트하고 있다. 나 같은 사람이 또 있다면 도움이 되길... Official Roary sites https://sanger-pathogens.github.io/Roary/ https://github.com/microgenomics/tutorials/blob/master/p..

https://fine-tuned.tistory.com/132 [cmd] 커맨드라인에서 알집으로 압축풀기 많은 파일을 반복적으로 다루어야 하는데 마우스 클릭을 계속하려니 느리고 짜증난다 리눅스에서 하려니 리눅스가 설치되어 있지도 않고 익숙하지도 않다 커맨드라인에서 zip, unzip, tar 사용하 fine-tuned.tistory.com 조금 전 포스팅에서 커맨드라인에서 알집으로 압축풀기를 다루었는데 잘 안되는 것이 있었다 alzipcon -x 파일명 을 실행하면 압축파일 안에는 별도의 폴더가 없는데도 기본적으로 확장자까지 포함된 파일명과 동일한 폴더를 만들고 그 안에 압축을 푸는 것이었다. -xf 옵션이 도움이 될까 싶어 alzipcon -xf 파일명 이렇게 실행시키면 ERROR : 잘못된 인자 : ..

많은 파일을 반복적으로 다루어야 하는데 마우스 클릭을 계속하려니 느리고 짜증난다 리눅스에서 하려니 리눅스가 설치되어 있지도 않고 익숙하지도 않다 커맨드라인에서 zip, unzip, tar 사용하려니 영어도 읽기 싫고 뭐가 자꾸 잘 안된다 이런 분들께 추천드린다 커맨드라인에서 알집으로 압축풀기 1. 환경 변수의 PATH에 알집이 설치되어 있는 경로를 추가하기 알집이 설치되어 있어도 원하는 폴더에서 사용하려면 Path에 알집의경로가 포함되어 있어야 한다. 그래야 내가 어느 폴더에 있든지 알집명령어를 사용할 수 있다. 제어판에서 환경변수 편집을 클릭한다. 우측 상단 검색 창에서 환경변수를 검색하면 바로 나온다. Path를 선택 후 편집을 클릭한다. Path를 더블클릭해도 동일하다 새로만들기를 클릭한다 알집이 ..