A Fine-Tuned Universe

Bioinformatics를 잘 하시는 분들은 스크립트로 여러가지 일을 뚝딱뚝딱 하시겠지만 많은 생물학 기반의 연구자와 대학원생들은 갑자기 유전체나 시퀀스 분석을 해야하는 상황을 만나면 당황할 수 밖에 없다. 많은 bioinformatics tool이 리눅스에서 돌아가는데 리눅스도 모르고 설치하는 것도 잘 모르겠고 각종 프로그래밍 언어도 모르고... 아무것도 모르는 상태에서 배워가면서 사용하면서 부딪히는 문제들을 두서없이 메모해서 업데이트하고 있다. 나 같은 사람이 또 있다면 도움이 되길... Official Roary sites https://sanger-pathogens.github.io/Roary/ https://github.com/microgenomics/tutorials/blob/master/p..

웹버전의 PGAP로 세균 유전체 분석을 해보려고 한다. http://pgaweb.vlcc.cn <Input file 얻기> NCBI Assembly 에 접속 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly ↓ 원하는 미생물 검색 후 assembly accession number 클릭 ↓ 오른쪽에 Download GenBank Assembly 클릭 ↓ 다운로드 받아야 할 파일들 (Accession number) cds_from_genomic.fna...